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混沌未分天地乱，茫茫渺渺无人见。自从盘古破鸿蒙，开辟从兹清浊辨。覆载群生仰至仁，发明万物皆成善。欲知造化会元功，须看《西游释厄传》。
天地之数，有十二万九千六百岁为一元。将一元分为十二会，乃子、丑、寅、卯、辰、巳、午、未、申、酉、戌、亥之十二支，每会该一万八百岁。天地以一元为一个周期，一个周期有十二万九千六百年，从黑暗到光明再到黑暗，生物从产生再到消亡。故事就发生在无数个周期中的一个，被称作西游世界。
西游世界前五千四百年，一团黑暗，称为混沌。又过了五千四百年逐渐开明，天始有根。再五千四百年清气上腾，有日月星辰，谓之四象。又经五千四百年，始成大地，再五千四百年，重浊下凝，有水火山石土，谓之五形。又经五千四百年，天气下降，地气上升，天地交合，群物皆生。群物值得是树木花草，再五千四百年生人，生兽，生禽，正谓天地人，三才定位，至此西游世界成。
西游世界从周期开始到人类万物产生一共用了6个五千四百年合计32400年。天地生群物的交合方式是平面相交，随着天气下降的高度越来越少，地气上升的高度也越来越少，最后能够得到交合之气的就是地上的最高峰——天柱也就是后来的花果山，换句话说天柱就是天地的生殖器，天地第一次在花果山顶交合，摩擦的落土，因为得到交合之气形成了上古的人类，第二次交合生走兽，最后一次交合生飞禽。自此天地再也没有交合，天高从此地远。
人类以盘古为首，走兽以麒麟为长，飞禽以凤凰为长。万物和人类都住在天柱周围，随着人类和万物的繁殖，西游世界的第一个矛盾就产生了，人类和万物的生存空间之争。为了争夺生存空间，人类和走兽、飞禽决裂。更为了争夺天柱的控制权，和西游世界的领导权，万物和人类展开了旷日持久的万物之战。
战斗的第一阶段，人类先下手为强，凭借作为天地交合最早的产物，拥有着先天优势，对万物进行偷袭，万物准备不足，人类把万物成功赶出了生命的发源地天柱。
战斗的第二阶段，面对人类的咄咄逼人，麒麟和凤凰决定在万寿（兽）山，集结全部战力，要和人类决一死战。为了争取更多的准备时间，蛇盘山鹰愁涧、黑风山黑风洞、黄风山黄风洞、流沙河四个关卡负责拖延人类的进军步伐。深林鹰凤聚千禽，古洞麒麟辖万兽，万寿山一场大战，留下累累白骨天地生成最早的人类死了不计其数，只要能活下来的最后都成长为后来的人类大神，其中有一个叫镇元子的年轻人被留下来守坟，他在白骨之上种了一棵树，这就是后来的人参果。
战斗的第三阶段，万物战败向西退却，人类紧追不放，白虎岭一站老虎之首白虎战死，所以西游世界没有出现顶级的大神级老虎，宝象国的首领大象、乌鸡国的毗蓝婆家族、枯松涧、黑水河、通天河都没能拦住人类的脚步，特别是黑水河一站，河水从清边红，从红变紫，最后变黑，已经不是血流成河，二是血流成黑了。在万物的逃亡过程中，有一只凤凰坠落落凤坡，无奈之下与鸟中至贱花鸨交合生下孔雀、大鹏，最后被人类剿杀，孔雀、大鹏最好吃人，乃是抱杀母之仇。因为这个偶然万物终于找到可以对抗人类的方法就是创造新的物种，凤凰和麒麟开始进行大规模的配种，人类的大军包围了麒麟山，麒麟不愿亲眼看自己的兄弟战死，也不想再逃，更为了掩护凤凰，决心在麒麟山与人类最后一战，结果世界再无麒麟，麒麟灭种。
战斗的第四阶段，剩下的万物达成共识一定要保证已经怀孕凤凰的安全，等待万物新一代领袖的诞生，在盘丝岭、狮驼岭、黑松林、隐雾山、豹头山、竹节山拼死抵抗，而这一些列战斗的领袖就是九头狮子九灵元圣，上通三圣，下彻九泉也绝非虚名，九灵元圣的竹节山为什么叫竹节？就是暗示在九曲盘桓洞内，利用地形优势，九灵元圣节节抵抗，寸土必争。但是无奈实力悬殊最终被人类团团包围，不忍受辱正要自杀，突然远处西方一声霹雳，随后天崩地裂、电闪雷鸣，他知道万物的希望来了，万物的领袖来了，放弃自杀被人类活捉，直到今天九灵元圣仍然没有放弃，他相信总有一天他会重获自由，终会有一天万物会重新夺回这个世界。
西游世界的第一场战役——万物之战在一声霹雳之中结束了，人类取得了对万物的完胜，万物领袖麒麟战死，人类更取得了对天柱的所有权，人类站到了西游世界权力的顶峰，通过万物之战更发现了这个世界除了天柱所在的岛屿，还有更广阔的陆地，这是一场战争，更是一场地理大发现。在战斗中，人类开始形成了管理层级，以居住天柱的位置，从下到上分成三层，上八洞三清、四帝、太乙天仙等众；中八洞玉皇、九垒、海岳神仙；下八洞幽冥教主，注世地仙。站在天柱顶峰的就是引领万物之战的盘古大神。
一声霹雳，一场天崩地裂之后，凤凰在牛族的拱卫之下，在青龙山产下了——祖龙，拥有着凤凰和麒麟的双重血统，他是当之无愧万物新一代的领袖，但是祖龙的数量太少而且年幼，万物最后的战力选择带着龙种继续向西撤离，最终来到灵山落脚，而此时自以为大获全胜的人类军团，并没有胜利的喜悦，因为他们发现了比战争更可怕的事情，离开天柱之后，他们在不断的衰老，他们发现自己的皮肤开始干瘪，头发褪去了颜色，他们陷入了前所未有的恐慌，比万物更可怕的是死亡，他们正在丧失不老不死的能力，他们不得不重回天柱，找寻返老还童、延续生命的方法，只好暂停了进攻的步伐。
远在灵山的祖龙获得了喘息的时间，他们不断的繁殖，来增加龙族的数量，于是第一代龙生龙产生，可是这毕竟太慢，对抗茫茫的人类军团，简直不堪一击，终于他们发现了一条捷径——万物化龙。在灵山，祖龙们通过龙尿的方式构建了化龙池，凡入龙池者皆可成龙。一直保卫祖龙的牛族成为第一批龙尿龙，如今掌管四海的敖家兄弟就在其中。伟大的龙族诞生了，龙族终于开始了蓄谋已久的复仇。
准备好一切的龙族在西方组建了强大的军团，他们向人类宣战，从西开始进军，人类遇到了从来没有见过的物种，见到了前所未有的战斗力，人类节节败退。龙族的凯歌之中，也隐隐藏着不安的因素，龙族分成三层，祖龙、龙生龙、龙尿龙，根据血统的纯洁程度，形成了金字塔形权力结构，底层数量庞大的龙尿龙备受压榨，愤怒不满在积累，而祖龙们却已经被胜利冲昏了头脑。龙族内部的分裂和矛盾很快被人类发现并且利用，他们和龙尿龙中的领头人敖家达成了协议，约定双方共同消灭真龙，天地一分为二，在最终决战来临之前，龙尿龙选择背叛了龙族。
敖家给祖龙提供了人类军团在平顶山的假情报，可以一举消灭人类，祖龙把真龙的全部战力投入到了平顶山，哪里知道这是一个灭亡龙族的致命圈套，人类要用平顶山的土活埋龙族。战斗打响不久，祖龙才发现这是一个陷阱，并且龙尿龙开始退出战场，祖龙、龙生龙陷入了层层包围，从天空中开始降下石头黄土，真龙血统就要被活埋，眼看大势已去，真龙不甘心受辱，随着祖龙的一声令下，群龙腾空，用身体撞向天际，真龙选择了自杀，他们要把天地毁掉，他们要和人类同归于尽，群龙的身体坠落被黄土掩埋，他们被埋之地被称为压龙山，平顶山顶平就是因为压龙。最后一只祖龙，看到此番场景不禁泪落，用尽全身的气力大吼一声，冲向天空，在一次又一次撞击之下，龙头滴血，天再也承受不住，一条缝隙从西北裂向东南，天终于塌了。天地瞬间失色，阴云密布，黑气席卷整个寰宇，海波翻腾，整个世界眼下就要毁于一旦。
人类的领袖盘古再一次站了出来，唯一能拯救这个世界的方法就是补天，他让自己的助手到昆仑山顶，打造了一根人造天柱，支撑起天，使天不在坠落。随后他来到天柱的顶峰，建起一座八卦炉，他要炼石补天。而补天的材料就是花果山顶的交合之土，这些土本来可以化成生灵，却再也没有机会了。交合之土被练成了补天石，盘古从天柱一直补到昆仑山，终于天被补好了，但是天柱再也不接天了。昆仑上顶的人造天柱就是后来的金箍棒，老祖炼石补天煽火的扇子就是芭蕉扇。
天地之间的危机终于解决了，很快人类便违背了和龙尿龙的协约，没有什么天地一分为二，要么死要么臣服，敖家一族最终选择了臣服，沦为了捕杀龙的急先锋，而这些龙肉都上了人类众神的餐桌。同时人类在补天石之上建起了最早的天宫，盘古因为他在万物之战、人龙之战和补天的三大功绩，被尊称为太上老祖，成为天地之间至高无上，独一无二的神，他补天的助手被称为太上老君。人类一统了天地，但是更大更可怕的敌人终于站到了他们的面前：死亡。
人类战胜了万物赢得了空间，但是人类迎来了更恐怖的敌人—时间。没有了时间就是死亡，人类终于意识到生命不是无限的，人类回到天柱，找到生命的真相-交合之气。生命的诞生来自交合之气，而延续生命同样需要交合之气。但是天地的距离越来越远，最后仅存的天柱也因为龙的毁天灭地而被老祖用来炼石补天。天地再也不能交合，交合之气不再产生，真龙把天撞塌，更使原本不多的交合之气大量的泄漏，这个效果就像气球撒气一样，没有了交合之气，人就会死。可以做这么一个比喻，补天石其实就是气球的一个补丁，要时时刻刻防止漏气。
人类陷入了前所未有的恐惧之中，他们畏惧死亡，和万物战死是可以控制的是一种荣誉而现在的死亡是必然的，是毫无意义的，没有人可以逃避的。但是并不意味着人类就此放弃了对长生的需求，人类出现了对于死亡态度的两个派别：一个是太上老祖主张的自然派，一切都交给天命。一个是太上老君为代表的修行派，后来发展成道教，他们研究交合之气，一定能找到获得交合之气的方法，各种长生实验雨后春笋的秘密开展起来，很快根据实验的结果发展出了一个新的派别剥夺派。如果交合之气不能自己产生，那么我们可以去将别人的交合之气夺为己有。那么如何抢夺呢？吃人肉。开始的时候人类吃万物肉后来吃龙肉，然而人类很快发现人肉的效果是最好的，获得的交合之气也最多。
人龙之战不久之后，人类为了夺取交合之气陷入了自相残杀，一切看起来都不可逆转，直到有一个人中八洞的玉皇拿出了蟠桃，在老祖链石补天的时候，玉皇私藏了一部分交合之土，并且交给后来的王母，王母在交合之土上种出了蟠桃。交合之土内含交合之气，结出来的果子自然也有交合之气，这和万寿山的人参果是一个道理，人类万物的尸骨化成了同样具有交合之气的土壤。蟠桃的横空出世，让人类终于不再自相残杀，原本中八洞玉皇的地位火箭般的蹿升。
太上老祖是自然派的代表，他无法接受人类对时间的篡改，他认为人类追求长生是个致命的错误，在他的眼里蟠桃的诞生就是个罪恶，他对所有的人类神仙宣布：长生是非法的，服用长生药就是罪恶。人类眼看永生不死的灵药蟠桃就在眼前，怎么可能会听从太上老祖的规劝。
为了毁掉蟠桃，老祖释放了十只金乌，也就是太阳，炙烤大地。蟠桃树眼瞅着就要被活活晒死，人类军团赫赫有名的先锋，后羿拿起自己的弓箭，九乌坠地，留下一个作为世间的灯塔。后羿成为了人类的救星，他和玉皇并列成为人类众神的领袖。同时人类众神再也不能容忍盘古对长生的破坏和阻拦，盘古必须死，他们撤销了盘古太上老祖的封号，高喊：吃蟠桃得永生，杀盘古得太平，杀向了天宫，可是人类众神在第一轮的交锋中没有战胜盘古，那么谁能够杀死盘古呢？谁杀死了盘古，谁就是人类至高无尚的神。后羿站了出来，他要去刺杀盘古，为了更方便的接近盘古，后羿要改头换面夺舍投胎。
此时的太上老君还隐藏着自己的身份，留在盘古的身边，盘古也根本不知道自己最亲爱的战友老君居然才是他最大的敌人，老君偷偷从昆仑山拿回天柱，并取其中最好的材质打造了九尺钉钯，约定后羿夺舍成功之后，拿着九尺钉钯拍死盘古。但是有一个人不能容忍后羿的成功，他就是蟠桃的主人——玉皇，他要做至高无尚的人类领袖。而后羿夺舍投胎之时就是除掉后羿的最好机会，他首先毁了后羿的肉身，随后又毁了后羿投胎的身体，后羿不能在有限的时间内投胎就会灰飞烟灭，后羿在最后一刻只好错投猪胎，灵魂就此沉睡，成为一头野猪流落下方。
后羿始终没有出现，但是人类已经没有那么多的时间等待，于是玉皇以谈判的名义邀请盘古赴宴，盘古太过于自信了，他带着老君去了，在酒席宴上人类突然发难，向盘古发动进攻，盘古有万夫不当之勇，但是他万万没想到老君一剑刺穿了他的胸膛，他曾经最亲密的助手，最好的战友背后捅了他一刀，盘古绝望的回头：是你。庞大的身躯倒地，化作一缕白烟。
人类战胜了盘古，蟠桃的主人玉皇被尊为上帝，也就是玉皇大帝，老君成为道祖，取代了太上老祖的地位。为了蟠桃的安全，玉帝将交合之土和蟠桃都搬上了天宫，修了蟠桃园。长生是合法的，没有任何人可以阻碍人类追求长生了，神仙的世界终于形成，但是盘古他真的死了吗？他又去哪了？一场新的大战正在酝酿之中。
盘古并没有死，他的肉身被毁，自己的一灵真性四处飘荡，来到一处山岭，后来被称为荆棘岭，寄居于一颗菩提树上，久而久之树化人形，菩提老祖诞生。菩提老祖有盘古之魂，没有盘古的身躯就丧失了旷古绝今的战力，他要想战胜现在的天庭，只有一个方案就是组建一支完全属于自己的军团。
第一步，菩提祖师首先召集忠诚于自己的部下，以及在天庭中不得势的边缘力量，其中有后来的燃灯古佛、如来、观音等。
第二步，菩提祖师拉拢战败之后四处逃难的万物将领，其中就有毗蓝婆、青毛狮子、大象等。
将两股势力合并组建了西方教，自己就是教主，他们的老师，但是这些力量远远不足以抗衡如日中天的人类众神，而且经受背叛的菩提祖师也并不信任他们，菩提只交给他们一个任务就是收集自开天辟地以来战死的人类和万物的魂魄。至于报酬，菩提许诺会给所有追随自己的人类和万物永生，那么如何永生呢？
菩提将收集到的魂魄注入树中造就了最早的一批树人，人变成树木就可以得到永生，因为树木可以扎根于地向天而生，可以自产交合之气，用现在科学的说法叫光合作用。盘古以菩提树的根茎关联了所有的树人，每个树人的想法，他都能第一时间的获得，他可以直接控制每个树人的一举一动，这样就再也不会有背叛了。跟随盘古的西方教很快就意识到了菩提的目的，菩提只给他们提供了一条路就是成为树人，彻底丧失自我意识，成为菩提操控的棋子。他们必须在长生和自由之中做一个选择，究竟要不要成为不死的植物人丧尸五感。如来解决的反对成为树人，他说：不自由毋宁死，我们是人不是树。很快西方教达成了共识并且立刻派人和天庭谈判，并且透露了菩提祖师的所有计划，菩提就是盘古他是这个世界最恐怖的敌人。树人军团在没日没夜的生产，人类必需立刻行动，天庭出动所有的战力，西方教会从内部响应。
菩提再一次被出卖了，第一次因为他的信任，第二次因为他的不信任，他的大树军团还没有形成，可是人类众神已经团团包围了荆棘岭，树人和众神大战，树人虽少但是依旧展现了人类所不具有的能力，无知无畏无痛无感，人类并不占优势，战斗就在焦灼之时，西方教中年轻领袖如来很快就发现了树人军团的致命弱点，只要切断菩提祖师和树人的关联，树人军团自然陷入崩溃，如来带着西方教围攻菩提，切断了菩提的树根，树人军团瞬间溃散，人类众神放起大火，尚未成长起来的数族就这么灭亡了。此时菩提祖师身边还有十八公等几个树人、还有与人类仇恨最深的万物领袖，他们被重重包围，老君走到最前：哥哥罢手吧，你没有机会了。菩提祖师一声长叹：念在战友情分，我愿自裁，但是请留下我身边人的活路。老君默许，菩提自焚，化成九颗舍利子，分散四方。老君遵从了约定，让西方教在菩提自焚之处建起一座庙宇祭祀他们的师父，留下树仙守坟。至于跟随菩提的万物将领狮子等，就交给西方教处理，他们都沦为佛祖菩萨的坐骑，不过保全了性命。
这场大战被称为第二次仙界大战又称树人之战，长生之战盘古身死，树人之战盘古魂死。因为时间关系，盘古的收集到的魂魄只有少数成为树人，魂魄也纳入了天庭的管理，成立了地府，并且分门别类绘制了生死簿，但是西方教却隐藏了一个天大的秘密就是他们还收集了龙魂，并且提前转移。根据如来和老君的协议，西方教改称为佛教，天庭承认佛教的合法地位，这就是化胡为佛。老君为佛教选派了一位领导弥勒佛又称东来佛祖，如来只做了佛老。尽管如此老君仍然不放心如来，因为他太有野心了，老君把如来流放到昆仑山，保证佛教不能对道教产生任何威胁。天地重获和平，但是新的矛盾又产生了，人类赢得了空间，夺得了时间，但是这些如何分配呢？为了争夺分配权，一场新的博弈已然开始。