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攻占基隆后，守序建立了台北地方政府的架子，梅登代理台北行政长官，全面主持台湾工作。只有经过元老院正式任命，梅登才能去掉头上的代理二字，这个问题只能等守序回去后才能解决。
勒内.阿勒芒卸任南海号舰长，转任为台北分舰队提督；第二野战营营长路德维希.菲尔霍夫转任台北陆军司令。三人均进入台北行政长官辖区评议会，守序学习了荷兰东印度公司阿姆斯特丹董事会的做法，他只直接任命了三位评议会成员，剩下两个名额交给评议会自行推荐。
台北行政长官公署就位于原来西班牙的长官公署内，梅登直接占据了冈萨洛.波蒂尼奥的办公室。在之前的战斗中，和平堡一些建筑设施被炮火打坏。在驻扎期间，金城的军队并没有大规模涉足台湾本岛，一部分人在和平岛，一部分人去了淡水。利用现有的官兵、战俘和从基隆临近番社征集到的人力，同时开启和平堡、社寮堡和淡水堡的修复扩建和重建工作。为了尽快投入使用，淡水堡并没有使用火山灰水泥，而是使用了传统的建设工艺。
长官公署是和平堡最先完成修理并装修好的建筑，家具基本沿用了西班牙人的存货，草创时期，守序和梅登都不想弄的太奢侈。
此时守序和梅登手捧酒杯站在梅登办公桌前，正欣赏着刚刚挂上去的守序大副戎装像，油画与南十字星鸟旗并列。画像中的守序身穿四分之三甲，手扶剑柄站立在社寮要塞的城头。投降的西班牙行政长官双手捧起佩剑，向守序弯腰行礼。远处的海面上，停泊着几艘战舰。
“一个月的时间，你的这幅画像终于完工了。”
守序对此很满意，“西班牙的人才确实多，小小的基隆城都能找到合格的画师和乐师。”
“基隆城虽小，却也是欧洲人进入中国的三个窗口之一。”
守序轻抿酒杯，大航海时代带来的不仅仅是贸易商品和欧洲武器，东西方的文化同样产生了碰撞。欧洲的油画和西方音乐此时都已经传入了中国。
所谓的三个交流窗口，即是葡萄牙人的澳门、荷兰人的大员和西班牙人的鸡笼。虽然荷兰人的大炮最猛，但荷兰乡巴佬在传播文化方面比葡萄牙和西班牙人还有一定差距。从几十年前澳门的罗明坚开始，欧洲的传教士、工程师便把欧洲的乐器带入了中国。利玛窦、郭居静、庞迪我、汤若望，均是精通音乐的复合型人才，这其中又尤以意大利人居多。庞迪我甚至还在万历皇帝的宫中教会了4名太监弹奏和弦。
守序在基隆城中找到了古钢琴、小提琴、大提琴、长笛、低音号、定音鼓、管风琴、羽管键琴、竖琴等等十余种乐器，差不多可以组建一支小型管弦乐队了。
梅登看着守序，“战俘里不少人都是我需要的人才。你想好怎么处理这帮战俘了吗？”
守序皱着眉，“我们现在不是海盗，打下基隆城，各国都在看着我们的行为。声誉也是重要的资源，不能再像以前一样强留俘虏了。”
“你还是决定释放他们？”
守序轻轻点头，“妇女儿童无条件释放。完成三座城堡的修建工作后，波蒂里奥以下所有西班牙军政俘虏也全部开释，当然他们要是自愿留下为我们工作也很好。”
“可我们没有船送他们回去。”
“我当然不会送他们去马尼拉，释放的俘虏都交给台南荷兰人，让他们处理。”
“邦板牙人和卡加延人呢？他们只是西班牙人的奴隶，我需要这批人力。”
“好吧，菲岛土著都留给你。”
梅登这才比较满意，“天主教修士和学校教师你打算怎么处理？他们也许会有很大用处。”
守序对这批天主教牧师感到很头痛，必须得承认，这个时代的知识很多都掌握在教会手里。传教对西方殖民扩张影响极大，西班牙人实际上是一手握紧刀剑，一手高举圣经征服了新大陆。在亚洲同样也不例外，只要信奉了天主教的土著，西班牙人会视他们为自己人，事实上也确实如此，教徒对西班牙人更忠诚。荷兰是新教国家，在传教方面没有西班牙人那么狂热，但对信教土著同样也是更为信任。任何殖民地长官，都会很支持牧师的传教工作。
守序问梅登，“你有什么建议？”
梅登轻轻摇晃酒杯，思考了一阵，“让我们先把天主教修士放在一边。还是从疟疾开始，无论在金城还是在基隆，你一直在强调蚊虫，也就是疟疾的危害。疟疾防控条例更新了数次，一次比一次繁复具体。”
守序点头，“我只能用不断灌输的方式让所有人重视疟疾的问题。在金鸡纳树长成之前，我们缺乏特效药。你在基隆尤其要注意，要督促士兵们做好卫生勤务工作。”
梅登道：“我会按照你的条例执行。你也不要太担心了，和平岛是个与大陆隔开的岩石岛屿，没有可怕的沼泽与湿地，西班牙人在此也经营了16年，各项基础设施都做的不错，岛上没有疟疾流行。”
守序：“和平岛我不担心，但你轻易不要踏上台湾本岛，即便要去也只能在冬天登岛。”
梅登：“你说过如今是个小冰河期，台北的冬天会下雪，所以不会有恶性疟原虫。难怪你进城后第一件事不是查看缴获的金银，而是去了军装仓库。”
恶性疟原虫对人类杀伤力最大，但对温度的敏感性也最高。恶性疟原虫需要摄氏22度以上气温维持3周才能繁殖，这接近了蚊子宿主的寿命，气温在摄氏18.9度以下，恶性疟就无法存活。间日疟原虫没有恶性疟那么挑剔，15度以上都可以存活。
守序笑了：“我看见了西班牙人堆在仓库里的毛皮大衣。虽然此前广东的华商对我说过台北的冬天比雷州冷，雷州又比海南冷。海南的冬天单衣就可以过，雷州要穿棉衣，而台北需要皮草。但总归亲眼检查过才能放心。”
毛皮大衣意味着此时基隆的冬天气温会在0度左右，至少冬天是安全的，一次大范围的降雪就会打断恶性疟原虫的繁殖。只是因为每年西南季风期频繁的人员交流，海船会把处于恶性疟原虫潜伏期的携带者重新带入台北，但这已经比本地不断繁殖的恶性疟原虫带来的危害小多了。
梅登叹了口气，“淡水那边，我们暂时可以像西班牙人那样，只维持住对淡水堡的控制，不深入淡水河上游的台北盆地。但基隆我必须要完全控制，西班牙人已经打下不错的基础。我肯定会有很多岸上的工作，如果只能在冬天登岛，我担心处理不过来。”
守序非常坚持，“这个问题没得商量。不光是你，陆军司令菲尔霍夫，海军台北分舰队提督阿勒芒，你们台北评议会的所有成员都不允许在冬天以外的时间登岛。除非陆军卫情分队确认台北已成低疟区，那需要很长的开发时间。”
梅登道，“好吧，既然你坚持，我只能服从。但我要提两个条件。”
“什么条件？”
“先把舰队里的黑人官兵全部留给我。”
因为立国在湿热地区，现在金城所有官员都深刻理解了黑人官兵的好处，他们不知道问题出在哪里，但他们能观察到黑人很少患上疟疾。守序没向官员们解释原因，那太超前了，不是现在的人能理解的。在撒哈拉以南非洲，由于长期进化，黑人中高达95%的人是达菲阴性，先天免疫间日疟，对一半种类的恶性疟有高度抵抗力。在疟疾高发区，黑人简直是开挂一般的存在。
见守序在犹豫，梅登说道：“西班牙人在基隆的档案里有对台北地区的人口统计，可能未必精确，但对我们也是重要的参考资料。从新竹开始一直到基隆的台北平原，总共有不到6000名土著，西班牙人控制了淡水堡附近和基隆地区的4个番社，只有1200人。”
梅登和守序暂时都没管宜兰。宜兰平原的人口比台北多，宜兰约有万人的土著。台北与宜兰之间被群山阻隔，没有可靠的陆上交通联系，宜兰的噶玛兰人也比较凶悍，难以管束。因此宜兰虽然能种植水稻，但那暂时不是守序拓殖的重点地区，现在他们关注的对象就是台北平原。
守序想了想，“这次的远征部队，包括陆海军在一起有200多黑人官兵，全部留给你？舰队会缺人。”
“对，我全要。而且不管他们原来是什么军种，我会一概把他们转为陆军。有了这200多人维持对熟番的日常控制，然后在冬天全面动员一次，我就能征服整个台北平原。这样就不会像西班牙人一样，连淡水堡的城门都不敢出。”梅登嘴角泛起一抹微笑，“至于你那边缺少的人手，你自己想办法吧。”
“好吧，好吧，都留给你。”守序无奈了，台北确实更困难，“但你不要在台北过多杀戮，只要番社服从我们的统治并向我们纳税，可以给他们一定程度的自治权。”
“我明白，人力是宝贵的，所以我还需要那批西班牙传教士。”
“你要传教士干什么？”
梅登耸耸肩，“至少接纳了天主教的番社，会比生番更文明一些，也更能为我所用。有了他们的帮助，我们的人可以减少在疫病区的暴露时间。”
没想到梅登的伏笔埋在这里，守序提醒他，“你不要在信仰上惹出大麻烦。阿勒芒他们都是胡格诺教徒。”
梅登：“相信我，我经历过天主教和新教之间的血战，没多少人比我更理解信仰分裂带来的隐患。我会处理好的，和平岛上只能有新教，但西班牙人在台湾本岛已经洗礼了数千人，如果要想更快开发台北，我得继承他们在这方面的遗产。”
虽然梅登信心满满，守序还是感到没把握，他问道，“台北是哪个修会的教区？”
“多明我会。”
西班牙是金城目前最显著的敌人，而教会作为西班牙殖民地最强的政治势力，这方面的情报守序自然也搜集了不少。西班牙人在菲律宾有5大修会组织，分别是圣奥古斯丁会、多明我会、方济各会、耶稣会和圣奥古斯丁住院会。天主教国王陛下给这些修会分配了各自的教区，也就是传教的地盘。各大修会之间为了争夺传教权和教区互相勾心斗角，经常把马尼拉大主教的训诫当空气，除非主教大人是本修会自己人。
与带有浓厚军事修会和征服色彩的耶稣会相比，多明我会的政治面貌更模糊一些。
守序心中一动，“你是不是已经找那些传教士谈过了？”
梅登微笑道：“当然，他们都同意留下来。”
守序：“我们是西班牙的敌人，为什么他们还会留下来？”
“我的执政官阁下。虽然我已经改宗，但我也曾经是个天主教徒。你可能很难理解天主教修士对传教的热情。他们冒着生命危险把那些食人生番和猎头族归化为文明的教徒，为的可不仅是替天主拯救更多的迷途羔羊，更重要的是那意味无尽的财富。”
守序：“我明白，在美洲我见过耶稣会的白银。天主教修会在各自的教区势力极大，耶稣会就是南美教区内最大的银行，控制了教区的经济命脉。”
梅登：“这段时间我与那些传教士有过不少交流，菲律宾天主教会的类银行组织比南美还神秘，连国王派人查账都查不动。”
守序：“可台湾是个不发达的殖民地，而且我们也不会允许他们在这里掌握政治和经济势力，多明我会的人有必要留下来继续传教？”
梅登摇摇头，“台北的经济再不发达，这里也有几千受过洗礼的教徒，没人会轻易放弃。”
守序：“可我不希望台北变成天主教势力占优势的地区。”
梅登道：“我给他们分配了教区，只能在现有番社中传教。你不是打算向台北移民20万人吗？几千天主教徒到时不会有什么影响。”
守序皱着眉，“这样当然没问题，但他们真的同意如此苛刻的条件？”
梅登一笑，“其实他们是为了中国的传教权。就像我们刚才说的，基隆、澳门和大员是欧洲人进入中国的三个窗口，荷兰人的大员不去管，澳门并不配合多明我会修士进入中国传教，那里是耶稣会的地盘。”
“你的意思是说，因为与耶稣会争夺中国传教权，多明我会选择了基隆作为进入中国的桥头堡。”
“完全正确。虽然多明我会的传教士在台湾有多人被淡水的生番杀死，但他们还坚持留在台湾的主要原因就是为了进入中国。已经有十几个传教士由于风暴和海盗死在了台湾海峡，不过他们还是对此坚持不懈。”梅登将杯中酒饮尽，“中国教区意味着几十上百万的迷途羔羊，我向他们许诺了，会帮助他们进入中国。”
许诺进入中国是空头支票，无所谓的事。守序想了想，“现在基隆有多少天主教传教士？”
“埃斯基韦尔神父、嘉彼拉神父、西六左卫门神父、园永神父，后面两个是日本人。此外还有几个佐理修士。”
守序叹了口气，“好吧，你是台北行政长官，你坚持有必要，那我同意。”
台北长官达到了目的，微笑着说道：“感谢执政官阁下的支持，天主教修士是西班牙驻军和番社中间的润滑剂，对我们来说，同样也是如此。”
西班牙人在台北地区有数座教堂，淡水堡与和平堡的两座已经被取缔，但他们在台湾本岛还剩下八尺门航道对岸汉人的涧内社区教堂、大巴里教堂、基毛里教堂，在宜兰的苏澳港还有一个司铎的住宅。通过这些教堂，西班牙人控制了淡水的八里芬社、基毛里社、三貂社和塞那社，宜兰那边也先后有600多人受洗。
多明我会的修士在台湾传教很和平，甘冒生命危险去调解番社内战，开办学校，甚至会请求西班牙驻军原谅杀死神父的番社。西班牙人下乡收税征募人力，都要带着神父，不然他们很难收到东西。
守序：“不谈传教士了，你对评议会剩下两个位置有什么想法？”
“财政部驻台北特派专员博格斯先生是合适选择，另外一个我还难以决定。”
“在我走之前尽快定下来。”
“好的……”
守序结束了会谈，离开长官公署。梅登随后释放了来自基隆几大番社的战俘，有了黑人士兵和传教士的协助，他迅速完成对基隆港周围地区的控制，并重新恢复对淡水河口附近八里分番社的统治。从东西两侧圈定了目前台北行政长官辖区的核心。
注：作者没查到1642年多明我会驻台神父名单，用1639年暂代。